Algorithmique de la bio-informatique

Public Concerné

Prérequis : Les auditeurs devront de préférence avoir assisté au cours BNF102 (langage Scheme et Python) ou sinon justifier d'un niveau suffisant en programmation 
Biologistes ou Informaticiens.
Titulaires d'un BTS de Biochimie, Biotechnologie, Biologie ou d'un DUT de Biologie appliquée (ou diplômes équivalents bac+2)
Titulaire d'un BTS ou d'une licence d'informatique ou diplôme de niveau équivalent.

L'avis des auditeurs

Les dernières réponses à l'enquête d'appréciation pour cet enseignement :

Présence et réussite aux examens

Pour l'année universitaire 2023-2024 :

  • Nombre d'inscrits : 17
  • Taux de présence à l'évaluation : 59%
  • Taux de réussite parmi les présents : 80%

Objectifs pédagogiques

Initier aux algorithmes utilisés pour les principaux programmes de bio-informatique.

Capacité et compétences acquises

Cette formation doit permettre aux auditeurs non initiés:
  •  de comprendre le fonctionnement des principaux algorithmes utilisés en bio-informatique.
  •  d'utiliser ces algorithmes de façon pertinente en fonction des besoins et des contextes.

Contenu de la formation

  • Principes fondamentaux de l'algorithmique et notions d'optimisation et d'accélération algorithmique
  • Algorithme de recherche de valeurs ou de texte
  • Algorithmes de tris
  • Algorithmes d'alignement deux à deux, d'alignement multiple et de recherche de motifs.
  • Algorithmes de recherche de similarités dans les banques: BLAST et FASTA
  • Recherche de gènes: méthodes heuristiques
 

 

Description des modalités de validation

Examen final

En alternance ou en formation continue en journée :

Merci de consulter directement le secrétariat pédagogique de votre formation pour obtenir le planning.

En formation « à la carte Hors Temps de Travail », en présentiel, à distance ou hybride :

Voir les dates, les lieux d'enseignement et les modalités d'inscription sur les sites internet des centres régionaux qui proposent cette formation.

  • Paris
    • Centre Cnam Paris
      • 2026-2027 2nd semestre: Formation en présentiel soir ou samedi
      • 2027-2028 2nd semestre: Formation en présentiel soir ou samedi
Code : BNF103
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crédits